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科技部（原國科會）獎項---獲獎人
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| 傑出研究獎 | 邱士華、洪士杰、李光申、謝仁俊、吳肇卿（3次）、林山陽（3次）、張仲明（2次）、周成功（3次）、王聲遠（3次）、朱廣邦（4次）、林清淵（2次）、韓韶華（3次）、蕭明熙、蘇宗笙（3次）、何志堃、何橈通（2次） |
| 傑出青年研究獎 |
邱士華
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| 吳大猷先生紀念獎 |
李光申
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| 傑出特約研究員獎 | 林山陽、吳肇卿、周成功 |
| 研究獎勵優等獎 | 胡承波（5次）、韓韶華（2次）、何志堃（4次）、林山陽（4次）、王聲遠（2次）、華瑜（3次）、蕭明熙（3次）、戚謹文、林清淵（3次）、沈弘德（3次）、吳肇卿、周成功、羅世農（3次）、蕭廣仁（3次）、何橈通（2次） |
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獎項名稱
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獲獎人
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| 教育部第十六屆國家講座 |
謝世良
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| 中研院年輕學者著作獎 |
李光申
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國際獎項
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獲獎人
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| 亞太學術領袖獎 |
林幸榮
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| 第十屆FERCAP年會最佳海報獎 |
台北榮總人體試驗委員會
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| 第十七屆亞太肝臟學會會長獎 |
吳肇卿
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| ISMRM Educational Stipend Award，International Society for Magnetic Resonance in Medicine |
鄭州閔
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| Allan B. Dove Memorial Medal Award，the Wire Association International |
林幸榮
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| Young Investigator & Best Presentation Award，the Society of Molecular Imaging |
邱士華
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| New Investigator Recognition Award，50th Annual Meeting of Orthopaedic Research Society |
李光申
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| Uchida International Award，日本循環器學研究振興財團國際研究獎 |
林幸榮
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獎項名稱
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獲獎人
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|---|---|
| 王民寧先生紀念基金會傑出醫藥研究貢獻成就獎 |
吳肇卿
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| 第九屆永信李天德醫藥科技獎青年醫藥科技獎 |
邱士華
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| 中華民國第二屆年輕學者生化科技發明創作獎 |
邱士華
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| 台北市醫師公會第廿屆杏林獎 |
黃志賢
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| 實證醫學應用類文獻查證用藥組競賽「金獎」 |
林春吉
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| 傑出青年心臟論文獎 |
王岡陵
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| 李鎮源教授藥理學研究傑出獎 |
邱士華
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| 中華民國心臟學會丁農獎 |
陳震寰、陳肇文、林幸榮
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| 台灣疼痛醫學會卓越講座獎 |
謝仁俊
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| 台灣幹細胞學會優良學術論文獎 |
李光申
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| 第十二屆吳天賜先生傑出醫學研究獎 |
謝仁俊
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| 第十屆東元科技獎 |
謝仁俊
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| 宋瑞樓教授傑出研究獎 |
吳肇卿
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| 姜必寧教授學術成就獎 |
林幸榮
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臺北榮民總醫院獎項
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獲獎人
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| 醫師學術論文獎 |
李光申（3次）、洪士杰、邱士華、陳肇文（2次）、李偉平、吳肇卿（5次）、林幸榮（3次）
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| 醫學創新獎 |
林清淵、邱士華（3次）、郭正典、洪士杰（2次）、謝仁俊、黃志賢、陳震寰、林永煬、鄭浩民
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| 學術論文獎、創新獎(研究人員組) |
楊德明
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| 五十週年院慶重大學術成就獎 |
吳肇卿、李光申、謝仁俊、林幸榮、陳肇文
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| 五十週年院慶創新性醫療技術與服務重大成就獎 |
郭正典
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| 五十週年院慶重要制度興革 |
吳肇卿
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| 醫教奉獻獎 |
楊令瑀、黃志賢、陳祖裕
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| 經典論文獎 |
李光申
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