醫學研究部成立時間：民國53年8月27日奉行政院核定
歷任主管：
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醫學研究部 (民國53年10月至83年4月)
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| 主管姓名 | 任期 | ||
| 盧致德(兼) | 民國53年10月至民國55年3月 | ||
| 彭達謀 | 民國55年3月至民國62年5月 | ||
| 盧致德(兼) | 民國62年6月至民國67年5月 | ||
| 鄒濟勳(兼) | 民國67年6月至民國68年9月 | ||
| 韓韶華 | 民國68年9月至民國79年6月 | ||
| 楊志剛 | 民國79年9月至民國83年4月 | ||
民國83年5 月1日醫學研究部和教學部兩單位合併，改稱教學研究部。
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教學研究部 (民國83年5月至102年10月)
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| 主管姓名 | 任期 |
| 何橈通 | 民國83年5月至民國98年5月 |
| 林幸榮 | 民國98年5月至民國102年10月 |
教學研究部下設醫學研究科，科主任為郭正典，教學圖藝組，組長為陳素真，及醫學圖書組。
民國102年11月1日起，經行政院組織改造，教學研究部再度分為醫學研究部和教學部兩個單位。
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醫學研究部
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| 主管姓名 | 任期 | ||
| 林幸榮 | 民國102年11月至民國106年7月 | ||
| 吳肇卿 | 民國106年7月至民國108年1月 | ||
醫學研究部下設4個科，分別為基礎研究科，科主任為霍德義；轉譯研究科，科主任為吳俊穎；及臨床研究科，科主任為顏厥全，臨床試驗科，科主任為江晨恩。
歷任醫學研究部主管
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| 盧致德 |
彭達謀 |
鄒濟勳 | 韓韶華 | 楊志剛 | 何橈通 | 林幸榮 | 吳肇卿 |
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