台北榮民總醫院於民國48年11月1日開幕，但在同年的3月1日本部已先行開始收容作業。當時醫務部門下設九部其中包括結核病部，於民國51年6月更名為胸腔部，下設結核科、非結核科。民國64年，胸腔部增設胸腔病診斷中心，之後又改名為一般胸腔科，持續為醫院和病患服務。
       胸腔部的一般胸腔科有幾個國內的創舉：1.是國內最先引進纖維支氣管鏡檢查的單位；2.是國內第一個引進早期肺癌光動力療法的部科；3.擁有全國唯一的螢光攝影導引支氣管鏡檢查室；4.擁有獨立細胞檢查室。獨立細胞檢查室，是胸腔部獨佔全台灣的特色，該室在民國50年代起就已作業，將支氣管鏡檢查或超音波切片之檢體做即時、快速的細胞學染色檢查，提供檢查醫師快速及正確診斷。
       就長期目標，一般胸腔病科及胸腔病診斷中心規劃持續精進介入性胸腔醫學，不僅在支氣管鏡檢查、胸腔超音波檢查及細胞學檢查，要與時俱進外，還涉足現今高科技之分子影像學、分子生物學、資料探勘及深度學習等，以求結合基礎科學、臨床胸腔醫學、資訊科技與相關產業，造褔胸腔疾病患者。