衛福部於107年9月6號公告開放微菌叢植入治療用於臨床反覆性或常規治療無效之困難梭狀桿菌感染。臺北榮總於108年3月27日成立微菌植入治療小組，制定嚴謹的健康捐贈者評估與篩檢流程，建構台灣專為微菌製備用之實驗室與微菌庫，以提供即時的醫療服務，並促進相關臨床之研究。
微菌叢植入治療為利用新鮮、冷凍或膠囊之方式，將健康捐贈者之腸道微生物植入因腸道微生物失調而罹病之病患，改變其腸道菌相。除了透過上下消化道內視鏡、鼻腸管或灌腸等方式外，臺北榮總是全國少數可使用口服膠囊植入的醫學中心。
除了困難梭狀桿菌感染，胃腸肝膽科目前也和其他專科合作，一起研發不同疾病之適應症：如肝腦病變、移植體抗宿主疾病等，期望可以造福更多病患。

推薦醫師：侯明志、羅景全、黃惠君、李癸汌、王彥博、李沛璋、張天恩